Bpifrance développe en partenariat avec les régions une offre de financement adaptée aux spécificités territoriales via des outils communs, en particulier pour le financement de l'innovation (Fonds régionaux d’innovation) et l'accès au crédit des entreprises (Fonds régionaux de garantie), couvrant la plupart des besoins des entreprises en matière de création, d’innovation et de développement.

De plus, des fonds régionaux ou interrégionaux d’investissement ont été mis en place souvent au côté des régions pour faciliter l’accès des PME aux fonds propres. La mise en commun des moyens financiers entre Bpifrance et les régions permet d’accroître l’efficacité des interventions, au service du développement des territoires et de l’emploi.

Enfin, en matière d'accompagnement des entreprises, Bpifrance s'associe avec les régions pour le déploiement d'accélérateurs TPE, PME ou ETI.